Sverige – Hälsovårdstjänster – SPR/260834 - Provision of genomic epidemiology and public health bioinformatics training

Den övergripande målet med denna upphandling är att förvärva ett ramavtal för att stärka kapaciteten för genomisk epidemiologi och bioinformatik för offentlig hälsa genom tvärvetenskapliga utbildningar, vilket är avgörande för svar under en pandemi eller oväntade större hälsohändelser. De allmänna målen med utbildningarna är att stödja länder i att bygga upp sin kapacitet i genomisk epidemiologi och bioinformatik för offentlig hälsa, och att öka tvärvetenskaplig samarbete mellan bioinformatiker, epidemiologer och mikrobiologer inom ett land för att underlätta den vanliga användningen av genomisk information för övervakning, beredskap och utbrottssvar. Aktiviteter ska också förbättra datadelning och samarbete mellan offentlig hälsoinstitutioner och ECDC, och förbättrade nätverksaktiviteter ska främja tvärgränsande samarbeten. Målgrupperna för utbildningarna är yrkesverksamma på offentlig hälsoinstitutioner med bakgrund i datavetenskap och bioinformatik; och yrkesverksamma på offentlig hälsoinstitutioner som inte har en specifik bakgrund i bioinformatik. Utbildningarnas mål är: * Att tillåta yrkesverksamma med bakgrund i datavetenskap och bioinformatik att: - förbättra och utöka sina färdigheter för att stärka sin kapacitet inom offentlig hälsbioinformatik; - bättre förstå behoven och koncepten inom epidemiologi och offentlig hälsomikrobiologi, med fokus på de inmatningar och utmatningar som krävs av deras kollegor (dvs. mikrobiologer, epidemiologer, yrkesverksamma inom offentlig hälsoövervakning och svar) för att ta snabba och informerade offentliga hälsåtgärder. * Att tillåta yrkesverksamma utan bakgrund i datavetenskap/bioinformatik att: - få en bättre förståelse för hur genomisk epidemiologi kan tillämpas i ett offentligt hälsosammanhang med särskild fokus på hur traditionella och genomiska data kan analyseras, tolkas och användas för offentlig hälsa; - bli mer bekanta med koncepten, formaten och konventionerna som vanligtvis används inom mikrobiell genomik, och få en bättre förståelse för hur strukturen och formatet på data kan användas för att strömlinjeprocessen för datanalys; - bättre förstå koncepten bakom och användningen av de vanligaste bioinformatiska verktygen och flöden som används för epidemiologiska analyser, inklusive begränsningar och möjliga alternativ; och - få en bättre översikt över de grundläggande principerna, alternativen och bästa praxis för datalagring, hantering och delning, med särskild inriktning på sekvenseringsdata och tillhörande metadata.