Schweden – Dienstleistungen des Gesundheitswesens – SPR/260834 - Provision of genomic epidemiology and public health bioinformatics training

Das Gesamtziel dieser Ausschreibung besteht darin, einen Rahmenvertrag zu beschaffen, um die Kapazitäten für die genomische Epidemiologie und die Bioinformatik im öffentlichen Gesundheitswesen durch interdisziplinäre Schulungen zu stärken, was für die Reaktion auf eine Pandemie oder unerwartete große öffentliche Gesundheitsereignisse entscheidend ist. Die allgemeinen Ziele der Schulungen bestehen darin, Länder bei der Entwicklung ihrer Kapazitäten in der genomischen Epidemiologie und Bioinformatik für öffentliche Gesundheitszwecke zu unterstützen und die interdisziplinäre Zusammenarbeit zwischen Bioinformatikern, Epidemiologen und Mikrobiologen innerhalb eines Landes zu fördern, um die routinemäßige Nutzung genomischer Informationen für Überwachung, Vorbereitung und Ausbruchsbekämpfung zu erleichtern. Die Aktivitäten sollen auch den Datenaustausch und die Zusammenarbeit zwischen öffentlichen Gesundheitsinstitutionen und dem ECDC verbessern, und verstärkte Vernetzungsaktivitäten werden grenzüberschreitende Zusammenarbeit fördern. Die Zielgruppen für die Schulungen sind Fachleute, die in öffentlichen Gesundheitsinstitutionen arbeiten und einen Hintergrund in Computational Biology und Bioinformatik haben; und Fachleute, die in öffentlichen Gesundheitsinstitutionen arbeiten und keinen spezifischen Hintergrund in Bioinformatik haben. Die Ziele der Schulungen sind: * Fachleuten mit einem Hintergrund in Computational Biology und Bioinformatik zu ermöglichen: - ihre Fähigkeiten zu erweitern und zu vertiefen, um ihre Kapazitäten im Bereich der Bioinformatik im öffentlichen Gesundheitswesen zu stärken; - die Bedürfnisse und Konzepte der Epidemiologie und der öffentlichen Gesundheitsmikrobiologie besser zu verstehen, mit einem Fokus auf die Eingaben und Ausgaben, die von ihren Kollegen (d.h. Mikrobiologen, Epidemiologen, Fachleuten für öffentliche Gesundheitsüberwachung und -reaktion) benötigt werden, um schnelle und fundierte öffentliche Gesundheitsmaßnahmen zu ergreifen. * Fachleuten ohne einen Hintergrund in Computational Biology/Bioinformatik zu ermöglichen: - ein besseres Verständnis dafür zu gewinnen, wie genomische Epidemiologie in einem öffentlichen Gesundheitskontext angewendet werden kann, mit besonderem Augenmerk darauf, wie traditionelle und genomische Daten gemeinsam analysiert, interpretiert und für öffentliche Gesundheitszwecke genutzt werden können; - sich mit den Konzepten, Formaten und Konventionen vertrauter zu machen, die in der mikrobiellen Genomik häufig verwendet werden, und ein besseres Verständnis dafür zu gewinnen, wie die Struktur und das Format der Daten verwendet werden können, um den Datenanalyseprozess zu optimieren; - die Konzepte hinter der Nutzung der häufigsten bioinformatischen Werkzeuge und Pipelines, die für epidemiologische Analysen verwendet werden, einschließlich deren Einschränkungen und möglicher Alternativen, besser zu verstehen; und - einen besseren Überblick über die grundlegenden Prinzipien, Optionen und Best Practices der Datenspeicherung, -verwaltung und -freigabe zu erhalten, mit einem besonderen Fokus auf Sequenzierungsdaten und zugehörigen Metadaten.