Allemagne – Services de recherche et développement et services de conseil connexes – Ganzgenomsequenzierung NAKO PAIS

L'objet du marché est le séquençage de l'ensemble du génome d'échantillons d'ADN humain hautement standardisés provenant de l'étude de santé NAKO dans le cadre du projet "NAKO-PAIS", financé par le BMFTR. Les échantillons à séquencer sont des échantillons d'ADN isolés à partir de couches de buffy. Le marché comprend la réception et le contrôle à l'entrée des échantillons d'ADN fournis, la préparation de bibliothèque sans PCR, le séquençage de l'ensemble du génome, le contrôle qualité interne de la performance de séquençage, la livraison des données brutes de séquençage dans Illumina ICA-Base, la livraison de métadonnées techniques définies dans Illumina ICA-Base et la documentation des processus de livraison des échantillons, des bibliothèques, des runs et des données. De plus, la répétition ou le reséquençage en cas de non-atteinte des paramètres de qualité définis, dans la mesure où la cause est dans le domaine de responsabilité de l'attributaire. C'est-à-dire dans tous les cas où les échantillons remplissent les critères de qualité d'entrée convenus. Ne font pas partie du marché, l'alignement, le variant calling, le génotypage commun, la création de produits d'analyse finaux tels que CRAM, gVCF, VCF ou msVCF, la gestion des données dans Illumina ICA-BASE, l'évaluation scientifique des données de séquençage ainsi que le traitement bioinformatique des données dans Illumina ICA avec DRAGEN. Les retours qualité, en particulier sur la couverture moyenne obtenue par échantillon, proviennent de ce traitement des données à l'attributaire et sont pertinents pour la réception ou la répétition ou le reséquençage. Objectif du projet : Depuis 2014, l'étude de santé NAKO examine 205 000 personnes âgées de 20 à 69 ans dans toute l'Allemagne dans 18 centres d'étude. Les participants sont invités à des examens de suivi à intervalles réguliers pour générer des données de santé à long terme. Un objectif central est d'étudier les causes moléculaires de l'apparition et de l'évolution des maladies ainsi que d'identifier des biomarqueurs pour la détection précoce des maladies courantes et la prévention personnalisée. Le stockage des bioproben humaines est centralisé au Helmholtz Munich et constitue une ressource précieuse pour la science. Le séquençage de l'ensemble du génome des participants à la NAKO, financé par le BMFTR, permet une caractérisation approfondie de l'architecture génétique de la population allemande, avec un accent particulier sur les maladies post-infectieuses. Réserve de financement : L'attribution du marché dans cette procédure de passation des marchés est soumise à l'octroi définitif des fonds tiers prévus pour l'acquisition ainsi qu'à la mise à disposition des fonds correspondants par l'organisme subventionnaire. Au moment du lancement de la procédure de passation des marchés, le décret de subvention définitif n'est pas encore disponible. Cependant, selon l'état actuel de la procédure de financement, il existe une attente légitime que la subvention demandée soit accordée. Le pouvoir adjudicateur mène la procédure de passation des marchés indépendamment de cela. L'attribution n'est cependant accordée que si le financement par l'organisme subventionnaire est définitivement approuvé et que les fonds nécessaires sont mis à disposition. Si, contre toute attente, la subvention demandée n'est pas accordée ou ne l'est pas dans une mesure suffisante pour l'exécution du marché, ou si, pour d'autres raisons, un financement suffisant n'est pas disponible, le pouvoir adjudicateur se réserve le droit d'annuler la procédure de passation des marchés conformément aux dispositions légales en matière de passation des marchés. Aucun droit à l'attribution n'existe jusqu'à son octroi.